استفاده موضعی از کرم اسید آزلائیک 20 درصد باعث کاهش قابل توجه تراکم میکروکوکاسه های پوستی و پروپیونی باکتریوم Sp داخل فولیکولی میشود و میزان اسید چرب لیپیدهای سطح پوست را کاهش می دهد. کرم موضعی اسید آزلائیک اثر ضد کراتینه کنندگی بر روی پوست آکنه دار نشان می دهد که با کاهش سنتز فیلاگرین مرتبط بود(پروتئین تجمع کننده رشته کراتین). بنابراین کاهش هیپرکراتوز فولیکولی ممکن است تا حدی زمینه ساز اثر ضد آکنه این دارو باشد. از آنجایی که اسید آزلائیک بر فرآیند قرنیه شدن سلول های اپیدرمی تأثیر می گذارد، از نظر درمانی تأثیر مثبتی بر تشکیل کومدون ها دارد. اسید آزلائیک همچنین آزاد شدن رادیکال اکسیژن از گرانولوسیت های نوتروفیل را مهار می کند و بنابراین ممکن است یک اثر ضد التهابی مرتبط بالینی در آکنه داشته باشد.